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365bet平台赌场:完成了飞子孝荔枝基因组的伪染色体水平组装

时间:2022/1/15 22:23:24   作者:   来源:   阅读:87   评论:0
内容摘要:“与柑橘、苹果、桃等其他散装水果相比,荔枝在基础研究水平上存在较大差距,育种技术也比较落后。破译荔枝基因组密码在开发新的育种技术和促进基础研究方面发挥着重要作用。”12年前,华南农业大学园艺学院研究员李建国的研究团队决定破译荔枝的基因组密码,揭开其起源和驯化的面纱。“在没有基因组的时代,只要有一颗野生荔枝,就可以被认为...


“与柑橘、苹果、桃等其他散装水果相比,荔枝在基础研究水平上存在较大差距,育种技术也比较落后。破译荔枝基因组密码在开发新的育种技术和促进基础研究方面发挥着重要作用。”

12年前,华南农业大学园艺学院研究员李建国的研究团队决定破译荔枝的基因组密码,揭开其起源和驯化的面纱。“在没有基因组的时代,只要有一颗野生荔枝,就可以被认为是起源的中心。野生荔枝最初是在我国南部发现的,后来在越南也发现了。荔枝的真正产地在哪里?土地在哪里?”李建国说。

科研团队从众多荔枝品种中选择飞子笑作为研究对象,“因为它是我国栽培范围最广、产量最高、鲜果销售周期最长的主栽品种,”研究人员表示。在本研究中,科研团队利用第二代Illumina、第三代PacBio、Hi-C、10X Genomics等最新的基因组测序数据,通过优化基因组组装策略,完成了飞子孝荔枝基因组的伪染色体水平组装。

令我们惊讶的是,飞子肖的基因组杂合度高达2.27%,这在植物中是非常罕见的。高杂合度在项目早期给基因组组装带来了巨大的挑战。”华南农业大学园艺学院院长胡贵兵感叹道。

最后,研究团队利用荔枝资源的72个重测序数据,鉴定出高质量的SNPs,并提出了荔枝“一个起源中心,两个独立驯化事件”的假设。



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